La gestió de la diversitat microbiana, un repte per als hospitals

Un estudi de la Universitat de les Illes Balears subratlla la importància de la vigilància i el monitoratge de les comunitats microbianes en els entorns hospitalaris per fer front als reptes que suposa la resistència als antibiòtics.

Un equip d’investigadors de la Universitat de les Illes Balears ha estudiat la diversitat microbiana en l’entorn hospitalari amb l’objectiu d’ampliar el coneixement que es té de la complexitat de les comunitats de microorganismes i, especialment, de la presència de bacteris resistents als antibiòtics.

En aquest context, José María Serpa Laço ha defensat recentment a la nostra universitat la seva tesi doctoral. Aquesta s’ha fet en el marc de l’activitat investigadora del grup de recerca en Microbiologia i Biotecnologia Ambiental (MICROBIAM), un grup de recerca consolidat d’R+D+I de la UIB, sota la direcció de la Dra. Margalida Gomila, catedràtica de Microbiologia de la Universitat de les Illes Balears. La recerca s’ha desenvolupat en el context del projecte europeu PEST-BIN: Piooneering Strategies Agains Bacterial Infections, una Innovative Training Network finançada per la Comissió Europea, en què han participat institucions de diversos països.

Durant un any, l’equip investigador va analitzar llocs diferents dels ambients hospitalaris i va cultivar mostres en diversos medis de cultiu, alguns amb pressió antibiòtica. Es varen obtenir 1.058 aïllats, que es varen identificar per espectrometria de masses (MALDI-TOF) i seqüenciació del gen ARNr 16S, que varen revelar fins a 67 espècies diferents de microorganismes.

Els resultats varen evidenciar una microbiota dinàmica i diversa als desguassos, que inclou patògens nosocomials ben coneguts (per exemple, P. aeruginosa, K. pneumoniae), juntament amb espècies menys conegudes amb potencial patogènic, com membres del grup P. putida i del gènere Stenotrophomonas. Una selecció d’aïllats d’aquests grups bacterians es varen seleccionar per fer una anàlisi més exhaustiva: es varen utilitzar la seqüenciació genòmica i enfocaments bioinformàtics. Els aïllats de Pseudomonas es varen analitzar també mitjançant eines de tipificació de microorganismes a partir del perfil de proteïnes (proteotyping). L’ús de la bioinformàtica per a les anàlisis de WGS i proteòmica va permetre identificar nous gens de resistència als antibiòtics (ARG), elements genètics mòbils i biomarcadors proteics específics d’espècies; destaca el paper de l’entorn hospitalari com a brou de cultiu per a la resistència antimicrobiana i l’evolució de patògens.

Recerca publicada a Frontiers in Microbiology

Part d’aquesta tesi doctoral s’ha publicat recentment a la prestigiosa revista científica Frontiers in Microbiology. En aquest article es presenten els resultats obtinguts en el seguiment d’un any dels diferents espais hospitalaris, que mostren una comunitat microbiana dinàmica i canviant, amb una presència destacada dels gèneres Pseudomonas i Stenotrophomonas. A més, molts dels aïllats testats varen mostrar resistència a múltiples fàrmacs, incloses espècies clínicament significatives com són Pseudomonas aeruginosa i Klebsiella pneumoniae.

L’estudi subratlla la importància de les estratègies de vigilància continuada, així com la necessitat d’un monitoratge constant per comprendre més bé la dinàmica microbiana i millorar la gestió dels riscos associats a la resistència antimicrobiana. La doctora Gomila, investigadora principal de l’estudi, destaca que «entendre més bé el funcionament d’aquests ecosistemes microbians és clau per desenvolupar estratègies que ajudin a frenar la propagació dels bacteris resistents als antibiòtics».

Referència bibliogràfica

Laço, J.; Martorell, S.; Gallegos, M. de C.; and Gomila, M. (2025) Yearlong analysis of bacterial diversity in hospital sink drains: culturomics, antibiotic resistance and implications for infection control. Frontiers in Microbiology, 15:1501170. doi: 10.3389/fmicb.2024.1501170

Data de publicació: 03/04/2025